同时，娜塔莎·诺曼诺夫被一个评估潜力的程序选中，被红房子买走。
但她的母亲一直尝试找到她，红房子领导人德雷科夫下令杀死她的母亲。
另一边，李洋也下达了铲除红房子的指令，娜塔莎及其母亲被九头蛇带走。
斯塔克工业，霍华德退休，因为托尼不想工作，其副手奥巴代亚担任临时CEO。
1992年
托尼浪子回头（玩腻了），继任斯塔克集团CEO。
特查卡收到祖瑞传来的情报，确认弟弟尼卓布背叛了瓦坎达，亲赴美国奥克兰杀死了背叛国家的弟弟，并让其子尼贾达卡自生自灭。
之后，李洋指示九头蛇带走尼贾达卡，改名艾瑞克·史蒂文斯，企图以后扶持他坐上瓦坎达王位，完好无损地接收瓦坎达各项资源。
1993年
九头蛇宇宙科技研发初见成效，李洋命令在太阳系内各大行星及重要地点建设永久基地。
所有船只、建筑均使用了隐形技术，地球上无人发现。
1994年
勇度再次来到地球，李洋与其达成委托协议。
1995年
斯克鲁帝国在与克里帝国的战争中战败，家园被毁，来到地球避难。
九头蛇庇护他们，他们则贡献斯克鲁帝国的知识遗产。
有了斯克鲁帝国的科技知识，和勇度的委托也被终止。
另外，佐拉算法发现尼克·弗瑞的副手卡罗尔新得到的一只从天而降的宠物猫有问题，李洋辨认后发现它居然是噬元兽咕咕。
考虑到它的超规格能力，李洋决定只是进行紧密监控，不采取任何行动。
同年，指控者罗南来到地球外。
这次没有了惊奇队长，李洋不得不利用升级过后的霍华德传送技术，用宇宙魔方将他们传送到宇宙里不知道哪个旮旯角里。
另一边，布鲁斯·班纳在哈佛读书时，和罗斯将军之女贝蒂开始约会，并一同参加科研项目。
1996年
九头蛇的太阳系内各行星永久基地建设成功。
1997年
九头蛇开始在小行星带上建立大型造船厂。
1998年
索科维亚发生战乱，一颗斯塔克工业制造的导弹砸穿马克西莫夫家，使夫妻双双阵亡，而旺达和皮特罗躲在床下看着导弹。
事实上，是旺达觉醒了混沌魔法修改了导弹爆炸的概率。
两兄妹从此成为孤儿，恨上了托尼。
李洋指示九头蛇带走了他们，并打算以后设法让他们把仇恨转移给奥巴代亚。
1999年
一场跨世纪博览会上，托尼结识了生物学家玛雅·汉森，并发生一夜情。
年轻的奥德里奇·基里安被托尼忽悠到天台上吹了一晚上风，恨上了托尼。
然而，AIM公司并没能诞生，事后两人均被九头蛇带走。
（编年史完）