当这种精神污染积累到临界值时，就会引人类dnaRna的结构性异变，将感染者转化为恐怖的尸变体。
通过某种未知的聚合机制，这些怪物最终会融合成吞噬万物的“血月”。
部分被神印彻底洗脑的人类成为了狂热的信徒，他们组建地下教会（因审核原因省略具体名称），暗中展势力。
这些极端分子坚信神印是推动人类进化的神圣媒介。
他们将人类现有的生理形态、痛苦与死亡，视为需要革除的缺陷。
鼓吹通过集体升维和意识融合来实现所谓的“终极进化”。
为此，他们不惜与联合政府公开对抗，在各殖民地策动骚乱，同时秘密复制大量神印以获取能源。
当石村号事件与泰坦空间站惨案接连爆后
潜伏在政府内部的教会势力趁机难，经过三年的精心运作，已完全掌握战略主动权。
星历2577年
教会正密谋对摇摇欲坠的联合政府动致命一击，企图夺取地球控制权。
与此同时
亲历过石村号与泰坦空间站双重噩梦的“艾萨克·克拉克”，却收到了一封特殊的求救信。
来信者是他的前女友艾莉，恳求他协助摧毁神印。
但饱经创伤的艾萨克已意志消沉，蜗居在月球殖民地拒绝了这一请求。
至此，《死亡空间3》的剧情由此展开。
一方面，联合政府在教会攻势下节节败退，大量复制神印被激活，全球范围内的尸变体感染已完全失控。
就连月球殖民地也在教会的攻击下沦陷。
另一方面，政府军指挥官诺顿与中士拉沃尔前来寻找艾萨克，请求艾萨克的帮助，前往遥远的星球解救遇险的艾莉。
艾莉坚信解决神印困境的钥匙不在地球，而在遥远的塔弗兰提斯冰封星球。
那里是神印的起源之地，可能藏着彻底消灭神印的方法。
艾萨克虽然对人类危机这种事情表现的无所谓，可他不能无视那位挚爱前女友的安危。
在对方亮出身份后，艾萨克决定同意与他们合作。
而艾萨克行踪的暴露自然引来了危险的教会军队。
一阵激战，战神工程师再次大神威，在教会的围追堵截中突出重围。
并在友军的帮助下，千钧一之际启动跃迁引擎，向着冰封星球疾驰而去。
……